Ανάπτυξη του αλγορίθμου BLASΤ σε περιβάλλον GPU

Γαλάνης, Λάμπρος

dc.contributor.advisor	Πικράκης, Άγγελος
dc.contributor.advisor	Ψαράκης, Μιχαήλ
dc.contributor.advisor	Τσιχριντζής, Γεώργιος
dc.contributor.author	Γαλάνης, Λάμπρος
dc.date.accessioned	2015-05-08T12:43:22Z
dc.date.available	2015-05-08T12:43:22Z
dc.date.issued	2014-10-30
dc.identifier.uri	https://dione.lib.unipi.gr/xmlui/handle/unipi/6586
dc.description.abstract	Η παρούσα εργασία καταπιάνεται με την ανάπτυξη του Αλγορίθμου BLAST μοριακής βιολογίας για την στοίχιση (alignment) μορίων πρωτεϊνών από μια βάση δεδομένων γνωστών πρωτεϊνών μιας άγνωστης ακολουθίας πρωτεΐνης. Επιπρόσθετα, παρουσιάζεται και προτείνεται και η χρησιμοποίηση μιας ή περισσοτέρων (συστοιχίας) καρτών – επεξεργαστών γραφικών για την επίσπευση της διαδικασίας μέσω πολυπαράλληλων υπολογισμών που μπορούν να προσφέρουν οι εν λόγω επεξεργαστές μέσω του framework CUDA Η εργασία αυτή χωρίζεται στις κάτωθι ενότητες: Προσδιορισμός του προβλήματος στοίχισης πρωτεϊνών, περιγραφή του αλγορίθμου BLAST, περιγραφή στοιχείων της πολυπαράλληλης επεξεργασίας με τη GPU και παρουσίαση του κώδικα για τους ζητούμενους υπολογισμούς. Εν κατακλείδι παρουσιάζονται τα αποτελέσματα και τα εξαγόμενα συμπεράσματα	el
dc.format.extent	60	el
dc.language.iso	el	el
dc.publisher	Πανεπιστήμιο Πειραιώς	el
dc.rights	Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 4.0 Διεθνές
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.el
dc.subject	Αλγόριθμοι	el
dc.subject	Bioinformatics	el
dc.subject	BLAST (Computer file)	el
dc.title	Ανάπτυξη του αλγορίθμου BLASΤ σε περιβάλλον GPU	el
dc.type	Master Thesis	el
europeana.isShownAt	https://dione.lib.unipi.gr/xmlui/handle/unipi/6586
dc.contributor.department	Σχολή Τεχνολογιών Πληροφορικής και Επικοινωνιών. Τμήμα Πληροφορικής	el
dc.identifier.call	572.80285 ΓΑΛ	el
dc.contributor.master	Πληροφορική	el

Files in this item

Name:: MPPL10018.pdf
Size:: 3.039Mb
Format:: PDF
Description:: Διπλωματική εργασία

View/Open

This item appears in the following Collection(s)

Τμήμα Πληροφορικής
Department of Informatics

Show simple item record

Except where otherwise noted, this item's license is described as
Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 4.0 Διεθνές