Ανάλυση γονιδιακών εκφράσεων για τη μελέτη του χρόνου επιβίωσης γυναικών με καρκίνου του μαστού

Abstract

Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η ανάλυση δεδομένων που χρησιμοποιούνται στην βιοϊατρική με στόχο τη μελέτη του χρόνου επιβίωσης σε γυναίκες με καρκίνο του μαστού. Αυτό γίνεται συνήθως με τον εντοπισμό και την ανάλυση βιολογικών καρκινικών δεικτών, βάσει των γονιδιακών εκφράσεων (gene expressions) των όγκων των ασθενών. Στην εργασία θα μελετηθούν πραγματικά δεδομένα που υπάρχουν για μια σειρά γονιδίων που μετρήθηκαν σε ιστούς ενός συνόλου ασθενών, αρχικά με την χρήση αρχικά μεθόδων ομαδοποίησης των γονιδίων, και στη συνέχεια με εξέταση του κατάλληλου μοντέλου από την ανάλυση επιβίωσης, η επίδραση που έχουν οι τιμές των γονιδιακών εκφράσεων στο χρόνο επιβίωσης των ασθενών. Οι μέθοδοι ομαδοποίησης των γονιδίων και τα μοντέλα επιβίωσης μελετήθηκαν με την εφαρμογή του προγράμματος εντολών R.