Έλεγχος πολλαπλών υποθέσεων σε μικροσυστοιχίες DNA
| dc.contributor.author | Παπακωνσταντίνου, Μαργαρίτα-Αργεντίνα Ν. | |
| dc.date.accessioned | 2007-11-02T07:29:59Z | |
| dc.date.available | 2007-11-02T07:29:59Z | |
| dc.date.issued | 2007-11-02T07:29:59Z | |
| dc.identifier.uri | https://dione.lib.unipi.gr/xmlui/handle/unipi/1992 | |
| dc.description.abstract | Οι μικροσυστοιχίες DNA αποτελούν τμήμα ενός καινούργιου και πολλά υποσχόμενου τομέα βιοτεχνολογίας ο οποίος μας επιτρέπει να παρατηρήσουμε ταυτοχρόνως χιλιάδες γονίδια και να καθορίσουμε ποια από αυτά είναι διαφορετικά εκφρασμένα σε ένα συγκεκριμένο τύπο κυττάρου. Το βιολογικό ερώτημα της διαφορετικής έκφρασης μπορεί να καθοριστεί εκ νέου σαν ένα πρόβλημα πολλαπλού ελέγχου υποθέσεων: του ταυτόχρονου ελέγχου, για κάθε γονίδιο, της μηδενικής υπόθεσης της μη ύπαρξης σχέσης μεταξύ των επιπέδων έκφρασης και ορισμένων αποκρίσεων ή συμμεταβλητών. Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η διερεύνηση και η παρουσίαση διαφορετικών προσεγγίσεων του ελέγχου πολλαπλών υποθέσεων μέσα στο πλαίσιο των πειραμάτων μικροσυστοιχιών DNA και η παρουσίαση αλγορίθμων για την εφαρμογή της minP και maxT προσαρμογής με σκοπό τον έλεγχο της family wise πιθανότητας σφάλματος, όπως επίσης και ενός bootstrap αλγορίθμου για τον προσδιορισμό των ακατέργαστων τιμών-p. Οι στατιστικές μέθοδοι εφαρμόστηκαν σε δύο πραγματικά σύνολα, από ασθενείς με λευχαιμία και από ασθενείς με καρκίνο του μαστού. Η ανάλυση πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας το Mathematica και το πρόγραμμα R. | |
| dc.language.iso | el | |
| dc.rights | Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 4.0 Διεθνές | |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.el | |
| dc.subject | DNA microarrays -- Statistical methods | |
| dc.subject | Multivariate analysis | |
| dc.subject | DNA microarrays -- Methodology | |
| dc.title | Έλεγχος πολλαπλών υποθέσεων σε μικροσυστοιχίες DNA | |
| dc.type | Master Thesis | |
| europeana.isShownAt | https://dione.lib.unipi.gr/xmlui/handle/unipi/1992 | |
| europeana.type | IMAGE | |
| dc.identifier.call | 572.8'636 ΠΑΠ | |
| dc.description.abstractEN | DNA microarrays are part of a new and promising class of biotechnologie that allows us to look at thousands of genes at once and determine which are expressed in a particular cell type. The biological question of differential expression can be restated as a problem in multiple hypothesis testing: the simultaneous test for each gene of the null hypothesis of no association between the expression levels and some responses or covariates. The purpose of the present study is to investigate and present different approaches to multiple hypothesis testing in the context of DNA microarray experiments and introduce algorithms for implementing the minP and maxT adjustment to control the family wise error rate as well as a bootstrap algorithm for the determination of the raw p-values. These statistical methods were applied on two real data sets, from leukemia patients and patient with breast cancer. The analysis was carried out using the Mathematica and the R-package. |
Αρχεία σε αυτό το τεκμήριο
Αυτό το τεκμήριο εμφανίζεται στις ακόλουθες συλλογές
-
Τμήμα Στατιστικής και Ασφαλιστικής Επιστήμης
Department of Statistics & Insurance Science
Εκτός από όπου διευκρινίζεται διαφορετικά, το τεκμήριο διανέμεται με την ακόλουθη άδεια:
Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 4.0 Διεθνές
Αναφορά Δημιουργού-Μη Εμπορική Χρήση-Όχι Παράγωγα Έργα 4.0 Διεθνές