Έλεγχος πολλαπλών υποθέσεων σε μικροσυστοιχίες DNA

Abstract

Οι μικροσυστοιχίες DNA αποτελούν τμήμα ενός καινούργιου και πολλά υποσχόμενου τομέα βιοτεχνολογίας ο οποίος μας επιτρέπει να παρατηρήσουμε ταυτοχρόνως χιλιάδες γονίδια και να καθορίσουμε ποια από αυτά είναι διαφορετικά εκφρασμένα σε ένα συγκεκριμένο τύπο κυττάρου. Το βιολογικό ερώτημα της διαφορετικής έκφρασης μπορεί να καθοριστεί εκ νέου σαν ένα πρόβλημα πολλαπλού ελέγχου υποθέσεων: του ταυτόχρονου ελέγχου, για κάθε γονίδιο, της μηδενικής υπόθεσης της μη ύπαρξης σχέσης μεταξύ των επιπέδων έκφρασης και ορισμένων αποκρίσεων ή συμμεταβλητών. Σκοπός της παρούσας εργασίας είναι η διερεύνηση και η παρουσίαση διαφορετικών προσεγγίσεων του ελέγχου πολλαπλών υποθέσεων μέσα στο πλαίσιο των πειραμάτων μικροσυστοιχιών DNA και η παρουσίαση αλγορίθμων για την εφαρμογή της minP και maxT προσαρμογής με σκοπό τον έλεγχο της family wise πιθανότητας σφάλματος, όπως επίσης και ενός bootstrap αλγορίθμου για τον προσδιορισμό των ακατέργαστων τιμών-p. Οι στατιστικές μέθοδοι εφαρμόστηκαν σε δύο πραγματικά σύνολα, από ασθενείς με λευχαιμία και από ασθενείς με καρκίνο του μαστού. Η ανάλυση πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας το Mathematica και το πρόγραμμα R.